Tanıda en önemli basamak öyküdür. Besin maddesinin alımından sonra bulgularının tanımlanması tipiktir. Besin maddesinin netleştirilmesi amacı ile hastalara diyet günlükleri tutturulabilir. Cilt alerji testi yapılabilir. Ancak kesin tanı için özel merkezlerde diyet sonrası o besin maddesine maruziyet ile test yapılabilir. Bu testin ciddi sonuçları olabileceği için uygun Alerji merkezlerinde yapılması gereklidir.

Besin alerjisi tanısı koyulmadan önce hastanın benzer belirtiler ile ortaya çıkabilecek olan hastalıklar açısından araştırılması gerekir. Bunlar arasında sindirim sisteminin yapısal hastalıkları, enzim eksiklikleri, gıda maddelerinin içine karışmış olan enfeksiyon ajanları ve toksik (zehirli) maddeler sayılabilir.